Para cumplir su propósito, CECTA organiza y coordina grupos multidisciplinarios de investigadores en torno a líneas de investigación en ciencia y tecnología de los alimentos, contribuyendo a la solución de problemas de interés para el sistema alimentario nacional, fomentando la vinculación y colaboración entre organismos nacionales e internacionales.
Estas capacidades en investigación y desarrollo se suman a una serie de servicios de asistencia técnica que CECTA pone a disposición de la industria de alimentos, por medio de sus laboratorios de Microbiología y Análisis Fisicoquímico, bajo un estricto sistema de aseguramiento de la calidad.
Desde 1986, CECTA ha acompañado al sector público y privado del sistema alimentario nacional, aportando con la generación y transferencia de conocimiento y tecnologías que han contribuido al desarrollo del país.